La fiecare apariție Revista Ortodoxia se deschide cu un editorial semnat de redacție, în care este prezentat conținutul celor șase rubrici din numărul respectiv, după cum urmează:
Studii, întâia și cea mai extinsă rubrică, cuprinde diferite studii din toate ramurile teologiei, semnate de profesori sau doctori în Teologie. Profilul acestei secțiuni reflectă aspecte însemnate ale cercetării teologice din trecut și prezent, cu relevanță pentru întreaga Ortodoxie.
Ortodoxia în dialog, prezintă articole care abordează valorile Ortodoxiei în lumina relației dintre credință, teologie, artă și știință.
Orthodoxia patristica, găzduiește traduceri fidele din textele clasice ale Sfinților Părinți.
Ortodoxia contemporană, aduce în atenție proiecte de cercetare sau studii ortodoxe întreprinse de teologi contemporani din străinătate.
Cronica Bisericilor Ortodoxe expune sintetic noutăți legate de evenimente importante din viața Bisericilor autocefale, cum ar fi alegeri de întâistătători ori trecerea la cele veșnice a unor cunoscuți ierarhi și teologi din întreaga lume ortodoxă.
Însemnări despre cărți și reviste, este rubrica care încheie revista cu menționarea celor mai recente cărți apărute în primul rând la Editurile Patriarhiei Române dar și la altele care tipăresc cărți reprezentative pentru teologia ortodoxă, prezentate în recenzii punctuale și foarte cuprinzătoare.